立命館大学 
増山研 分子栄養学研究室

ゲノム情報の入手

ゲノム情報の入手、保存

  • Web検索サイトに「ゲノム情報」と入力し、検索結果を表示
  • NARO DNA Bank URLをクリック https://www.dna.affrc.go.jp/links/jp/genome.html
  • マウスの場合、“動物” カテゴリー内の “Mouse Genome Database” をクリック
  • MGI Mouse Genome Informatics が表示される

   画面左上部 黄色の検索欄 “Keywords, Symbols, or IDs” boxに、検索したい分子名を入力

  • Quick Search Resultsが表示される。欲しい情報と思われる”Symbol”をクリック
  • Gene Detailが表示される。画面が表示される。“Sequences &Gene Models”の欄の“Representative Sequences”の表より、必要な情報をチェックする。 

   例)ゲノムDNA配列を知りたい “genomic”の左の○にチェック
     RNA配列を知りたい “transcript” の左の○にチェック
     タンパクのアミノ酸配列を知りたい “polypeptide” の左の○にチェック

  • 表の下のFor the selected sequence ”download in FASTA format”となっているのを確認し、”Go”をクリック
  • 配列情報の画面に切り替わる
  • ApEソフトウェアを起動する
  • ゲノム等情報のページから配列をコピーし、AEの新規画面にペースト
  • 生物種、分子名、ゲノム、RNA、タンパクの別を記載したファイル名で保存する

   例)マウス ビタミンD受容体 ゲノム の場合、mVdr gene

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立命館大学 
食マネジメント学部
増山研 分子栄養学研究室

〒525-8577

滋賀県 草津市 野路東 1-1-1
アクロスウィング606
TEL/FAX 077-599-3057
実験室内線 (6162)

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業務内容:実験作業およびデータ整理の補助

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